ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่มีฐานเป็นซัลโฟนาไมด์ ซึ่งมีฤทธิ์ต้านจุลินทรีย์และยับยั้งเอนไซม์คาร์บอนิกอะนไฮเดรส ช่วยในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่ใช้งานได้ โดยกลุ่มอะมิโนเมทิลช่วยให้เกิดปฏิกิริยาการจับคู่ในเคมียารักษาโรค นอกจากนี้ยังใช้ในการออกแบบตัวยับยั้งเอนไซม์และลิแกนด์ตัวรับ เนื่องจากความสามารถในการเลียนแบบอนุพันธ์ของกรดอะมิโนหอม รูปแบบเกลือไฮโดรคลอไรด์ช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียรในสภาพแวดล้อมปฏิกิริยาน้ำ