ใช้หลักๆ เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถนำหมู่ฟังก์ชันที่มีกำมะถันเข้าไปได้ ซึ่งสำคัญในการพัฒนาโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ใช้บ่อยในการเตรียมลิแกนด์รับรู้เฉพาะและตัวยับยั้งเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้ในการผลิตสารกำจัดเชื้อราและสารควบคุมการเจริญเติบโตของพืชบางชนิด เนื่องจากความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพในสิ่งมีชีวิตเป้าหมาย หมู่เอมีนและไทโออีเทอร์ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์อินทรีย์หลายขั้นตอนที่ต้องการปฏิกิริยาเฉพาะเจาะจง