ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์และตัวต่อต้านตัวรับ โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่มีความเสถียรทางเมแทบอลิซึมที่ดีขึ้นและความสัมพันธ์ในการจับที่ดีขึ้น ใช้กันอย่างแพร่หลายในเคมียารักษาเพื่อปรับปรุงยาตัวสมัครที่เล็งเป้าไปยังโรคระบบประสาทส่วนกลางและโรคอักเสบ โครงสร้างแซคทิดีนที่ป้องกันด้วย Boc ช่วยให้การฟังก์ชันนาไลเซชันแบบเลือกได้ ทำให้มีคุณค่าในการสังเคราะห์เปปไทด์แบบเฟสของแข็งและเฟสของเหลว นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมอนุพันธ์ฟลูออรีนเพื่อเพิ่มคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ เช่น ความสามารถในการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์และความต้านทานต่อการย่อยสลายแบบออกซิเดชัน