5,8-Diaza-spiro[3.5]nonane dihydrochloride เป็นสารเคมีที่ใช้ในงานวิจัยทางเคมีและเภสัชวิทยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้างเฉพาะของมันทำให้มีศักยภาพในการเป็นสารตั้งต้นสำหรับการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางยา นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์หรือตัวรับในร่างกาย ซึ่งเป็นประโยชน์ในการออกแบบยาใหม่ๆ ที่มีประสิทธิภาพสูงและมีผลข้างเคียงน้อย