2-Boc-2,6-diaza-spiro[3.3]heptane hydrochloride ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และเคมียาเป็นส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ โครงสร้างสไปโรไซคลิกของมันทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างกรอบโมเลกุลที่ถูกจำกัดและแข็ง ซึ่งมักต้องการในการออกแบบยาเพื่อเพิ่มความเลือกและความเสถียร

ในการค้นพบยา มันทำหน้าที่เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบที่เล็งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท เช่น ความวิตกกังวล ภาวะซึมเศร้า และโรคจิตเภท เนื่องจากความสามารถในการปรับตัวรับในระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมเพปไทโดมิมิติกส์ ซึ่งเลียนแบบโครงสร้างและหน้าที่ของเปปไทด์ ช่วยในการพัฒนายับยั้งเอนไซม์หรือตัวปรับตัวรับ

กลุ่มปกป้อง Boc (tert-butoxycarbonyl) ในโมเลกุลช่วยให้สามารถถอดออกอย่างเลือกเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน ทำให้สามารถสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนได้อย่างแม่นยำ สารประกอบนี้มีประโยชน์อย่างยิ่งในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิก ซึ่งพบได้บ่อยในโมเลกุลที่ hoạt độngทางชีวภาพ การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายารักษาใหม่ที่มีคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ที่ดีขึ้น