ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างเป็นพิพีรีดีนเชิงซ้อน ซึ่งมีความสำคัญในงานวิจัยด้านเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการพัฒนายาที่ต้องการความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพสูง เช่น ยาแก้ปวด ยาทางระบบประสาท หรือสารยับยั้งเอนไซม์เฉพาะชนิด โครงสร้างไซโคลอินเดนและพิพีรีดีนที่มีศูนย์ไม่สมมาตรช่วยให้ได้สารผลิตภัณฑ์ที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพดีขึ้น และลดผลข้างเคียงจากสารที่ไม่ต้องการ โดยทั่วไปใช้ในขั้นตอนการสร้างสารตัวอย่าง (lead compound) ในการค้นคว้ายาใหม่