5,9-Dioxaspiro[3.5]non-7-ylmethanol ถูกนำมาใช้หลักๆ ในด้านการสังเคราะห์สารอินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นที่หลากหลาย โครงสร้าง spirocyclic ที่ไม่เหมือนใครทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร สารนี้มักถูกใช้ในการสังเคราะห์สารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ ซึ่งหมู่ฟังก์ชันสามารถถูกปรับเปลี่ยนเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพยาหรือความจำเพาะต่อเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังพบการใช้งานในวิทยาศาสตร์วัสดุ ในการสร้างโพลิเมอร์ขั้นสูงและสารเคลือบที่มีคุณสมบัติเฉพาะ ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันยังทำให้เป็นผู้สมัครที่เหมาะสมสำหรับการวิจัยปฏิกิริยาเคมีใหม่และกระบวนการเร่งปฏิกิริยา