Furo[3,2-c]pyridin-4-amine ถูกนำไปใช้หลัก ๆ ในสาขาเคมีเภสัชกรรมเป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ต่าง ๆ โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ทำให้มีคุณค่าในการพัฒนายารักษาโรคทางระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงความวิตกกังวลและภาวะซึมเศร้า นอกจากนี้ ยังเป็นหน่วยย่อยพื้นฐานในการสร้างโมเลกุลที่มีศักยภาพต้านการอักเสบและต้านจุลินทรีย์ นักวิจัยยังสำรวจการนำไปใช้ในการออกแบบสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกใหม่สำหรับการบำบัดมะเร็ง โดยอาศัยความสามารถในการโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพอย่างมีประสิทธิภาพ การประยุกต์ใช้ขยายไปสู่การวิจัยเกษตรเคมี ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนายาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่