ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นตัวป้องกันหมู่อะมิโน (amine protecting group) ระหว่างขั้นตอนการสังเคราะห์สารที่มีโครงสร้างซับซ้อน โดยเฉพาะในยาที่มีโครงสร้างเป็นสาร heterocyclic หรือสารที่มีศูนย์ไม่สมมาตรหลายตำแหน่ง เนื่องจากกลุ่ม tert-butyl carbamate (Boc) มีความเสถียรต่อสภาวะเบสและสามารถกำจัดออกได้ภายใต้สภาวะกรดอ่อน ทำให้ควบคุมปฏิกิริยาได้ง่ายและให้ผลผลิตที่บริสุทธิ์สูง เหมาะสำหรับการใช้ในขั้นตอนสังเคราะห์แบบหลายขั้นตอน (multi-step synthesis) โดยเฉพาะในงานวิจัยและพัฒนายาใหม่