ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีโครงสร้างสไปโรอินโดลิน ซึ่งมักพบในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในงานวิจัยด้านยาที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง เช่น ยาต้านอาการซึมเศร้า หรือยาปรับอารมณ์ โครงสร้างพิเพอริดีนที่ถูกป้องกันด้วยกลุ่ม tert-butoxycarbonyl (Boc) ทำให้สามารถควบคุมการเกิดปฏิกิริยาต่อไปได้อย่างแม่นยำในขั้นตอนการสังเคราะห์หลายขั้นตอน นอกจากนี้ กลุ่มเมท็อกซีบนวงแหวนอินโดลินช่วยเพิ่มความสามารถในการละลายและมีผลต่อการจับกับตัวรับในระบบชีวภาพ จึงนิยมใช้ในงานพัฒนายาเชิงโครงสร้าง