3-keto Sphinganine (d6:0) hydrochloride (3-keto-C6-Dihydrosphingosine) ถูกนำมาใช้หลัก ๆ ในการวิจัย lipidomics และ sphingolipid โดยทำหน้าที่เป็น internal standard ที่ติดฉลากด้วยไอโซโทปเสถียร (deuterium-labeled) สำหรับการวิเคราะห์ปริมาณและศึกษาการเมตาบอลิซึมของ sphingolipid ซึ่งเป็นส่วนประกอบสำคัญของเยื่อหุ้มเซลล์และมีบทบาทในกระบวนการส่งสัญญาณภายในเซลล์ สารนี้ช่วยในการศึกษากลไกทางเอนไซม์ โดยเฉพาะเส้นทางที่เกี่ยวข้องกับ sphinganine และอนุพันธ์ของมัน ซึ่งสำคัญต่อการเข้าใจกระบวนการเซลล์ เช่น การตายของเซลล์ (apoptosis) การเพิ่มจำนวนเซลล์ (proliferation) และการส่งสัญญาณ (signal transduction) การประยุกต์ใช้ครอบคลุมการวิจัยความผิดปกติทางเมตาบอลิซึมและโรคที่เกี่ยวข้องกับการควบคุม sphingolipid ที่ผิดปกติ เช่น มะเร็ง เบาหวาน และโรคเสื่อมถอยของระบบประสาท นอกจากนี้ ยังใช้ในเทคนิค mass spectrometry เพื่อให้การวัดระดับ sphingolipid ในตัวอย่างชีวภาพมีความถูกต้องและ reproducible สูง โดยอาจทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในสังเคราะห์ sphingolipid สำหรับศึกษาเอนไซม์ เช่น serine palmitoyltransferase (SPT) และโรคทางพันธุกรรมที่เกี่ยวข้อง