Sepharose CL-6B ใช้กันอย่างแพร่หลายในชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุลสำหรับการทำให้บริสุทธิ์และแยกสารชีวโมเลกุล มีประสิทธิภาพสูงเป็นพิเศษในโครมาโทกราฟีแบบเจลฟิลเทรชัน ซึ่งช่วยแยกโปรตีน กรดนิวคลีอิก และแมคโครโมเลกุลอื่นๆ ตามขนาด โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีประโยชน์สำหรับการแยกโมเลกุลขนาดใหญ่หรือคอมเพล็กซ์ เช่น แอนติบอดี เอนไซม์ และโพลีแซคคาไรด์ โครงสร้างแบบครอสลิงก์ให้ความเสถียรเชิงกลที่ยอดเยี่ยม ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในระบบโครมาโทกราฟีความดันต่ำและระบบโครมาโทกราฟีของเหลวประสิทธิภาพสูง นอกจากนี้ Sepharose CL-6B ยังใช้ในโครมาโทกราฟีแบบแอฟฟินิตี เมื่อคู่กับลิแกนด์เฉพาะเพื่อทำให้บริสุทธิ์โมเลกุลเป้าหมายด้วยความจำเพาะสูง ความหลากหลายและความน่าเชื่อถือทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในงานวิจัย การวินิจฉัย และกระบวนการชีวภาพอุตสาหกรรม