ใช้เป็นตัวป้องกันแบบซิลิล (silyl protecting group) ในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในการป้องกันหมู่แอลกอฮอล์และหมู่อื่นๆ ที่มีขั้ว (polar functional groups) ระหว่างปฏิกิริยาหลายขั้นตอน หมู่ tert-butyldimethylsilyl (TBS) ที่มีขนาดใหญ่ให้การป้องกันแบบ steric shielding เพิ่มความเลือกและความเสถียรภายใต้สภาวะปฏิกิริยาต่างๆ นิยมใช้ในเคมีนิวคลีโอไซด์และคาร์โบไฮเดรต ซึ่งต้องการการควบคุมปฏิกิริยาอย่างแม่นยำ หมู่ N,N-dimethylsulfonamide ช่วยเพิ่มความละลายในตัวทำละลายอินทรีย์และอำนวยความสะดวกในการทำให้บริสุทธิ์ มีความเสถียรภายใต้สภาวะเบสและกรดอ่อนๆ อนุญาตให้ใช้กลยุทธ์การกำจัดป้องกันแบบต่อเนื่องในการประกอบโมเลกุลซับซ้อน เช่น ในสังเคราะห์ยาและผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ สามารถกำจัดป้องกันได้ด้วยสารเฉพาะ เช่น กรดฟลูออรีน หรือ TBAF โดยไม่ทำลายโครงสร้างอื่นๆ