Trimethoxy(1H,1H,2H,2H-nonafluorohexyl)silane ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารปรับสภาพพื้นผิวเพื่อมอบคุณสมบัติกันน้ำและกันน้ำมันให้กับวัสดุต่างๆ มักใช้ในสารเคลือบสำหรับกระจก เซรามิก และโลหะ เพื่อเพิ่มความสามารถในการกันน้ำและกันน้ำมัน ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในการป้องกันการหมอกและคราบเปื้อน ในอุตสาหกรรมสิ่งทอ ใช้ในการรักษาผ้า ให้ความต้านทานต่อน้ำ น้ำมัน และสิ่งสกปรก นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นสารเชื่อมในวัสดุคอมโพสิต ช่วยปรับปรุงการยึดเกาะระหว่างส่วนประกอบออร์แกนิกและอนินทรีย์ กลุ่มฟลูออโรอัลคิลของมันยังมีคุณค่าในการสร้างสารเคลือบที่มีพลังงานพื้นผิวต่ำสำหรับอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์และเลนส์แสง เพื่อให้มั่นใจในความทนทานและประสิทธิภาพในสภาพแวดล้อมที่ท้าทาย