ใช้ในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตั้งต้นสำหรับเภสัชภัณฑ์และสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการพัฒนาสารปรับตัวรับเซโรโทนินและสารที่มีฤทธิ์ต่อระบบประสาทอื่นๆ ใช้กันอย่างแพร่หลายในการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับยาพื้นฐานอินโดล โดยเฉพาะในการศึกษาความผิดปกติของระบบประสาทส่วนกลาง นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและสารสำหรับการถ่ายภาพ เนื่องจากแกนอินโดลมีคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่เหมาะสม มักมีส่วนร่วมในการทำปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิงเพื่อเพิ่มความหลากหลายของโมเลกุลในเคมียารักษาโรค