ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนา modulator ของตัวรับเซโรโทนิน และสารสำหรับระบบประสาทส่วนกลาง โครงสร้างของมันสนับสนุนการสร้างโมเลกุลอินโดลที่ซับซ้อนซึ่งพบในสารชีวภาพที่ออกฤทธิ์ ใช้บ่อยในเคมียารักษาเพื่อสร้างอนุพันธ์ในโปรแกรมค้นพบยาที่มุ่งเป้าไปที่โรคทางระบบประสาทและการอักเสบ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและสารสำหรับการถ่ายภาพ เนื่องจากแกนอินโดลมีคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่ดี โครงสร้างที่มีหมู่โบรมีและหมู่คาร์บอกซิลิกช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาต่อได้ง่าย ทำให้เหมาะสำหรับการปรับแต่งโครงสร้างในขั้นตอนการสังเคราะห์ยาต้นแบบ