tert-Butyl 7-methyl-1H-indole-1-carboxylate ใช้เป็นตัวกลางที่ได้รับการป้องกันในงานสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการผลิตตัวปรับตัวรับเซโรโทนินและยากลุ่มระบบประสาทส่วนกลางอื่นๆ หมู่ tert-butyl carboxylate (Boc) ทำหน้าที่ป้องกันหมู่ไนโตรเจนในตำแหน่ง 1 ของโครงสร้าง 7-methylindole เพื่อป้องกันปฏิกิริยาที่ไม่พึงประสงค์ระหว่างกระบวนการสังเคราะห์ โครงสร้างอินโดลที่มีการแทนที่ที่ตำแหน่ง 7 ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพ เช่น ยาต้านซึมเศร้าและยารักษาโรคจิต ใช้บ่อยในงานวิจัยเพื่อพัฒนาสารอนุพันธ์อินโดลชนิดใหม่ที่มีศักยภาพในการรักษา สามารถกำจัดหมู่ป้องกัน Boc ออกได้ภายใต้สภาวะกรดเพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์อินโดลที่ต้องการ นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวิจัยเกษตรเคมีสำหรับพัฒนายากระตุ้นการเจริญเติบโตของพืช เนื่องจากมีความคล้ายคลึงกับอนุพันธ์อินโดลจากธรรมชาติ