(2-Fluoro-6-methoxyphenyl)methanamine hydrochloride เป็นสารเคมีที่ใช้ในกระบวนการสังเคราะห์ทางเคมี โดยเฉพาะในสาขาเคมียารักษาโรค (medicinal chemistry) ในฐานะสารกลางสำคัญ (key intermediate) ในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ออกฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาต่างๆ มันมีบทบาทสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่เล็งเป้าไปที่ความผิดปกติทางระบบประสาท (neurological disorders) โดยเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับตัวรับเซโรโทนิน (serotonin receptors) คุณสมบัติโครงสร้างของมัน ซึ่งมีทั้งฟลูออรีนและเมทอกซีกรุ๊ป ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีค่าในการออกแบบยาที่มีศักยภาพต้านซึมเศร้า (antidepressant), ลดความวิตกกังวล (anxiolytic) หรือต้านไซโคติก (antipsychotic) นอกจากนี้ ยังถูกสำรวจในการวิจัยสำหรับการประยุกต์ใช้ในการสร้างตัวแทนบำบัดใหม่สำหรับการจัดการความเจ็บปวด (pain management) และสภาวะอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับระบบประสาทส่วนกลาง (central nervous system-related conditions) ความหลากหลายในการเกิดปฏิกิริยาเคมียังทำให้มีประโยชน์ในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะ