5,7-ไดคลอโรทริปตามีนไฮโดรคลอไรด์ ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัย โดยเฉพาะการศึกษารับเซอร์เซโรโทนินและกลไกการทำงานของมัน เป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าในการทำความเข้าใจปฏิกิริยาระหว่างอนุพันธ์ทริปตามีนกับอนุพันธ์รับเซอร์เซโรโทนินต่างๆ สารประกอบนี้มักถูกใช้ในงานทดลองทางเภสัชวิทยาเพื่อตรวจสอบผลกระทบต่อระบบประสาทส่วนกลาง รวมถึงคุณสมบัติ psychoactive ที่อาจเกิดขึ้น นอกจากนี้ยังถูกใช้ในการพัฒนายาใหม่ที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาทและจิตเวช เช่น ภาวะซึมเศร้า ความวิตกกังวล และโรคจิตเภท (schizophrenia) บทบาทของมันในการสำรวจความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (structure-activity relationships) ของอนุพันธ์ทริปตามีนยังช่วยส่งเสริมความก้าวหน้าในเคมียารักษาโรค