3,4-Dichloroisocoumarin ใช้เป็นสารยับยั้งเอนไซม์โปรตีเอส ซึ่งมีบทบาทสำคัญในการศึกษาวิจัยทางชีววิทยาและชีวเคมี โดยเฉพาะในการวิจัยเกี่ยวกับกระบวนการย่อยโปรตีนและการควบคุมกิจกรรมของเอนไซม์ นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษากลไกการทำงานของเอนไซม์และผลกระทบต่อเซลล์ในสภาวะต่าง ๆ อีกทั้งยังมีศักยภาพในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาต้านมะเร็ง เนื่องจากสามารถยับยั้งการทำงานของเอนไซม์ที่เกี่ยวข้องกับการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งและการอักเสบ