Pipendoxifene hydrochloride ถูกนำมาใช้ในการวิจัยทางการแพทย์เพื่อศึกษาประสิทธิภาพในการรักษาโรคที่เกี่ยวข้องกับฮอร์โมน เช่น มะเร็งเต้านม โดยเฉพาะมะเร็งเต้านมที่ตอบสนองต่อฮอร์โมนเอสโตรเจน เนื่องจากมีคุณสมบัติในการยับยั้งตัวรับเอสโตรเจน ซึ่งอาจช่วยลดการเจริญเติบโตของเซลล์มะเร็งได้ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาว่าสารนี้มีศักยภาพในการป้องกันภาวะกระดูกพรุนในผู้หญิงวัยหมดประจำเดือน เนื่องจากสามารถช่วยรักษาความหนาแน่นของกระดูกได้ อย่างไรก็ตาม การใช้งานยังอยู่ในขั้นตอนการวิจัยและทดลองทางคลินิก เพื่อประเมินประสิทธิภาพและความปลอดภัยก่อนนำมาใช้จริง