ไฮดรอกซีอะพาไทต์ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในทางการแพทย์และทันตกรรม เนื่องจากมีโครงสร้างและองค์ประกอบคล้ายกับกระดูกและฟันของมนุษย์ จึงมักใช้เป็นวัสดุปลูกถ่ายและโครงนั่งร้านสำหรับวิศวกรรมเนื้อเยื่อเพื่อช่วยในการซ่อมแซมกระดูกที่เสียหาย เสริมสร้างกระดูกใหม่ และส่งเสริมการสร้างกระดูกใหม่ นอกจากนี้ยังใช้ในการเคลือบผิวของโลหะเพื่อเพิ่มความเข้ากันได้ทางชีวภาพของอุปกรณ์ทางการแพทย์ เช่น ข้อเทียมและรากฟันเทียม ในด้านทันตกรรม ไฮดรอกซีอะพาไทต์ถูกใช้ในผลิตภัณฑ์ยาสีฟันและน้ำยาบ้วนปากเพื่อช่วยในการฟื้นฟูแร่ธาตุของฟัน ลดอาการเสียวฟัน และป้องกันฟันผุ นอกจากนี้ยังมีการวิจัยในการใช้ไฮดรอกซีอะพาไทต์เป็นตัวนำส่งยาในระบบการรักษาแบบควบคุมได้ และเนื่องจากความสามารถในการดูดซับโลหะหนัก จึงนำมาใช้ในงานสิ่งแวดล้อมสำหรับการบำบัดน้ำและปรับปรุงดิน