ไอโอดีนถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในฐานะสารฆ่าเชื้อและยาฆ่าเชื้อในสถานพยาบาล โดยเฉพาะสำหรับทำความสะอาดบาดแผลและฆ่าเชื้อผิวหนังก่อนการผ่าตัด เป็นส่วนประกอบหลักในสารละลายโพวิโดน-ไอโอดีน ซึ่งมีประสิทธิภาพต่อแบคทีเรีย ไวรัส และเชื้อรา ในอุตสาหกรรมอาหาร ไอโอดีนใช้เป็นสารฆ่าเชื้อสำหรับอุปกรณ์และพื้นผิวเพื่อป้องกันการปนเปื้อน นอกจากนี้ยังมีบทบาทสำคัญในกระบวนการบำบัดน้ำ โดยช่วยกำจัดจุลินทรีย์ที่เป็นอันตรายในน้ำดื่ม ไอโอดีนยังจำเป็นในการผลิตสีย้อม หมึก และสารเคมีสำหรับภาพถ่ายบางชนิด ในด้านการเกษตร ใช้เป็นอาหารเสริมสำหรับปศุสัตว์เพื่อป้องกันภาวะขาดไอโอดีน ไอโซโทปกัมมันตรังสีของไอโอดีนถูกนำมาใช้ในการถ่ายภาพทางการแพทย์และการรักษามะเร็ง โดยเฉพาะโรคที่เกี่ยวข้องกับต่อมไทรอยด์