ไอโอดีนโมโนคลอไรด์ใช้หลักในฐานะสารตัวแทนฮาโลเจนในสังเคราะห์อินทรีย์ โดยช่วยในการนำอะตอมไอโอดีนเข้าไปในโมเลกุลอินทรีย์ ซึ่งมีความสำคัญต่อการผลิตสารประกอบไอโอดีน มีบทบาทเป็นสารฆ่าเชื้อและยาฆ่าเชื้อที่ทรงพลังในสถานพยาบาลและห้องปฏิบัติการ โดยมีประสิทธิภาพในการกำจัดแบคทีเรีย ไวรัส และเชื้อรา ในเคมีวิเคราะห์ ใช้เป็นรีเอเจนต์สำหรับการไทเทรชันไอโอโดเมทรีเพื่อหาความเข้มข้นของสารรีดิวซ์ นอกจากนี้ยังมีส่วนในการเตรียมสีย้อมและยา ซึ่งต้องการการฮาโลเจนชันที่แม่นยำ คุณสมบัติการออกซิเดชันที่แรงทำให้มีประโยชน์ในกระบวนการอุตสาหกรรมต่างๆ รวมถึงการบำบัดน้ำและการสังเคราะห์วัสดุ