ไอโอดีนโมโนคลอไรด์ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารตัวแทนฮาโลเจนในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะสำหรับการไอโอดีนของสารประกอบอะโรมาติก มันช่วยในการนำอะตอมไอโอดีนเข้าไปในโมเลกุลอินทรีย์ ซึ่งจำเป็นต่อการผลิตยา สีย้อม และสารเคมีละเอียดอื่นๆ ในเคมีวิเคราะห์ มันทำหน้าที่เป็นรีเอเจนต์สำหรับการตรวจสอบสารประกอบไม่อิ่มตัว ช่วยในการระบุและวัดปริมาณพันธะคู่หรือพันธะทริปเปิลในสารอินทรีย์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมสารประกอบอินทรีย์ที่ไอโอดีน ซึ่งเป็นสารกลางที่มีคุณค่าต่อกระบวนการเคมีต่างๆ บทบาทของมันในแอปพลิเคชันเหล่านี้แสดงให้เห็นถึงความสำคัญในทั้งภาคอุตสาหกรรมและห้องปฏิบัติการ