แอมโมเนียมเฮกซะฟลูออโรฟอสเฟตถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารเติมแต่งอิเล็กโทรไลต์ในแบตเตอรี่ลิเธียมไอออน โดยช่วยเพิ่มความนำไฟฟ้าและปรับปรุงประสิทธิภาพของแบตเตอรี่ นอกจากนี้ ยังนำมาใช้ในงานเคมีไฟฟ้า เช่น การเตรียมไอออนิกเหลว เนื่องจากความเสถียรและคุณสมบัติที่ไม่ทำปฏิกิริยาได้ง่าย ในงานสังเคราะห์อินทรีย์ ทำหน้าที่เป็นคาวน์เตอร์ไอออนในการแยกและแยกไอออนบวก เพื่ออำนวยความสะดวกในการเกิดปฏิกิริยาเคมีต่างๆ นอกจากนี้ ยังใช้ในการผลิตสารเคมีพิเศษและวัสดุ โดยเฉพาะในกระบวนการที่ต้องการไอออนที่ไม่จับคู่กับโลหะ และมีบทบาทสำคัญในอุตสาหกรรมการรักษาพื้นผิวและเคลือบ ซึ่งช่วยปรับเปลี่ยนคุณสมบัติของวัสดุเพื่อเพิ่มความทนทานและการทำงานที่ดีขึ้น รวมถึงการใช้ในกระบวนการเคลือบโลหะเพื่อป้องกันการกัดกร่อน สารเติมแต่งในสารเคลือบผิวเพื่อเพิ่มความทนทานต่อความชื้นและสารเคมี และในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์เป็นส่วนประกอบในสารเคลือบป้องกันสำหรับแผงวงจรเพื่อป้องกันการเกิดออกซิเดชันและยืดอายุการใช้งาน