แอมโมเนียมเฮกซะฟลูออโรฟอสเฟตถูกใช้อย่างแพร่หลายในสาขาเคมีไฟฟ้า โดยเฉพาะอย่างยิ่งเป็นสารอิเล็กโทรไลต์ในแบตเตอรี่ลิเธียมไอออน ความนำไอออนสูงและความเสถียรภายใต้สภาวะต่างๆ ทำให้เป็นส่วนประกอบที่เหมาะสมสำหรับปรับปรุงประสิทธิภาพของแบตเตอรี่ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบฟลูออรีนอื่นๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในเคมีอินทรีย์และอนินทรีย์ ในเคมีวิเคราะห์ ถูกใช้เป็นตัวเรข่ายสำหรับโครมาโทกราฟีไอออนเพื่อแยกและตรวจจับไอออนเฉพาะเจาะจง บทบาทของมันในการผลิตสารเคมีพิเศษและวัสดุ เช่น การเคลือบผิวและโพลิเมอร์ ยังเน้นย้ำถึงความหลากหลายในการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม