สารละลายไอโอดีนถูกใช้อย่างแพร่หลายในด้านการแพทย์เพื่อการฆ่าเชื้อทำความสะอาดผิวหนังก่อนทำการผ่าตัดหรือฉีดยา ช่วยลดความเสี่ยงในการติดเชื้อจากแผล ยังใช้ล้างบาดแผลตื้นๆ เพื่อป้องกันแบคทีเรียเจริญเติบโต นอกจากนี้ยังใช้ในห้องปฏิบัติการเพื่อตรวจสอบสารต่างๆ เช่น การตรวจสอบแป้งในตัวอย่างอาหาร ซึ่งจะให้สีน้ำเงินเข้มเมื่อเจอกับแป้ง สารละลายไอโอดีนยังมีบทบาทในการบำบัดน้ำในกรณีฉุกเฉิน โดยช่วยฆ่าเชื้อจุลินทรีย์ที่เป็นอันตราย ทำให้น้ำดื่มได้ชั่วคราว อย่างไรก็ตามต้องใช้ในปริมาณที่เหมาะสมและไม่ควรดื่มเป็นเวลานาน