สารละลายมาตรฐานแอมโมเนียมไทโอไซยาเนต ใช้เป็นสารอ้างอิงในการวิเคราะห์ปริมาณไอออนโลหะต่างๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาไทเทรตแบบเพรซิพิเทชัน (Precipitation titration) เช่น การวิเคราะห์ปริมาณเงิน (Silver) หรือฮาโลเจนในตัวอย่าง โดยใช้เป็นตัวทำละลายหรือตัวบ่งชี้ในระบบการวิเคราะห์ที่ต้องการความแม่นยำสูง นิยมใช้ในห้องปฏิบัติการควบคุมคุณภาพในอุตสาหกรรมเคมี ยา และสิ่งแวดล้อม รวมถึงใช้ในการสอบเทียบเครื่องมือวิเคราะห์เพื่อให้ได้ผลที่เชื่อถือได้