สารละลายมาตรฐานโซเดียมไทโอไซยาเนต ถูกใช้เป็นตัวมาตรฐานในการวิเคราะห์ปริมาณไอออนโลหะต่างๆ โดยเฉพาะเหล็ก (Fe³⁺) ในการวิเคราะห์แบบสเปกโตรโฟโตเมตรี เนื่องจากสามารถทำปฏิกิริยากับเหล็กให้เกิดสารประกอบที่มีสีแดงชัดเจน ซึ่งสามารถวัดความเข้มของสีได้ตามความเข้มข้นของโลหะ การใช้งานนี้จึงนิยมในห้องปฏิบัติการตรวจสอบคุณภาพน้ำ โลหะในอุตสาหกรรม และตัวอย่างทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการสอบเทียบเครื่องมือวิเคราะห์เพื่อให้ผลการตรวจวัดมีความแม่นยำและเชื่อถือได้