แอมโมเนียมเฮกซะคลอโรรูทีเนต(IV) ใช้หลักๆ ในสาขาการเร่งปฏิกิริยา (catalysis) โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ตัวเร่งปฏิกิริยาที่มีรูทีเนียมเป็นองค์ประกอบ ตัวเร่งปฏิกิริยาเหล่านี้มีความสำคัญในกระบวนการแปลงสารอินทรีย์ต่างๆ เช่น การไฮโดรเจนเนชันและการออกซิเดชัน ซึ่งจำเป็นต่อการผลิตสารเคมีละเอียด (fine chemicals) และยา นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมสารประกอบรูทีเนียมสำหรับการศึกษาไฟฟ้าเคมีและวิทยาศาสตร์วัสดุ โดยเฉพาะในการพัฒนาวัสดุนำไฟฟ้าและกึ่งตัวนำ บทบาทของมันในงานวิจัยและกระบวนการอุตสาหกรรมเน้นย้ำถึงความสำคัญในการพัฒนาการสังเคราะห์ทางเคมีและนวัตกรรมวัสดุ