โซเดียมโบเรตบัฟเฟอร์ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในงานชีวเคมีและชีววิทยาโมเลกุล เนื่องจากสามารถรักษาค่า pH ให้คงที่ โดยทั่วไปอยู่ในช่วง 8.0 ถึง 9.5 มักใช้ในเทคนิคอิเล็กโทรโฟรีซิส โดยเฉพาะการแยกดีเอ็นเอและอาร์เอ็นเอในระบบเจลอะการ์ส บัฟเฟอร์นี้ช่วยให้การเคลื่อนที่ของกรดนิวคลีอิกสม่ำเสมอ โดยให้ความเข้มข้นไอออนและสภาวะ pH ที่เหมาะสม

นอกจากนี้ยังใช้ในเทคนิคไฮบริดิไซเซชัน เช่น Southern และ Northern blotting ซึ่งช่วยรักษาสภาพแวดล้อมที่จำเป็นสำหรับการจับตัวของโพรบ ในงานทดสอบเอนไซม์ โซเดียมโบเรตบัฟเฟอร์สนับสนุนกิจกรรมของเอนไซม์ที่ทำงานดีที่สุดในสภาวะด่าง รวมถึงฟอสฟาทาสบางชนิดและเดไฮโดรเจเนส

นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการชำระล้างและวิเคราะห์โปรตีน โดยเฉพาะในขั้นตอนที่เกี่ยวข้องกับการโต้ตอบแบบ affinity ของโบเรต เช่น การแยกกไลโคโอโปรตีนและโปรตีนที่จับนิวคลีโอไทด์ ความเข้ากันได้กับวิธีการตรวจจับต่างๆ ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในงานไมโครเพลตและการวิเคราะห์สเปกโตรโฟโตเมตรี

ในงานอุตสาหกรรม โซเดียมโบเรตบัฟเฟอร์ใช้ในน้ำยาทำความสะอาดและสารกันเสีย ซึ่งความคงที่ของ pH และคุณสมบัติต้านจุลินทรีย์อ่อนๆ มีประโยชน์ รวมถึงในผลิตภัณฑ์ทำความสะอาดเลนส์คอนแทคต์ที่ช่วยควบคุม pH และลดการระคายเคืองต่อตา