ฟลูออราพาซินถูกใช้เป็นสารกำจัดสัตว์ฟันแทะ โดยเฉพาะหนู ซึ่งทำงานโดยการรบกวนระบบการหายใจของเซลล์ในร่างกายของสัตว์ ทำให้เกิดการสะสมของกรดแลคติกและนำไปสู่ภาวะกรดในเลือด จนทำให้สัตว์เป้าหมายเสียชีวิต สารนี้มีฤทธิ์แรงและใช้ในรูปของเหยื่อล่อ ซึ่งมักถูกวางในพื้นที่ที่มีการพบหนูชุกชุม เช่น โรงเก็บของ ฟาร์ม หรือท่อระบายน้ำ เนื่องจากฟลูออราพาซินมีพิษสูงและอาจเป็นอันตรายต่อสัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมอื่นๆ รวมถึงมนุษย์ การใช้สารนี้จึงต้องระมัดระวังอย่างมาก ควรหลีกเลี่ยงการสัมผัสโดยตรง และต้องเก็บให้พ้นมือเด็กและสัตว์เลี้ยง มักมีการควบคุมการใช้สารนี้ตามกฎหมายในหลายประเทศเพื่อป้องกันอุบัติเหตุและการปนเปื้อนสิ่งแวดล้อม