Rhodamine B isothiocyanate ใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารติดฉลากเรืองแสงในงานวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะสำหรับการติดแท็กโปรตีน แอนติบอดี และสารชีวโมเลกุลอื่นๆ เนื่องจากมีคุณสมบัติการเรืองแสงที่เข้มข้น สารนี้มักใช้ในกล้องจุลทรรศน์ฟลูออเรสเซนต์ โฟลว์ไซโตเมทรี และการตรวจอิมมูโนฟลูออเรสเซนต์ เพื่อแสดงภาพและติดตามส่วนประกอบหรือกระบวนการในเซลล์ ความสามารถในการจับติดแบบโคเวเลนต์กับกลุ่มอะมิโนในโปรตีนทำให้เป็นเครื่องมือที่เชื่อถือได้ในการสร้างคอนจูเกตเรืองแสงที่เสถียร นอกจากนี้ ยังใช้ในงานวินิจฉัย เช่น การตรวจจับแอนติเจนหรือพาธาเจนเฉพาะในตัวอย่างทางคลินิก คุณสมบัติการปล่อยแสงสว่างและความทนทานต่อแสงทำให้เป็นตัวเลือกที่เหมาะสมสำหรับเทคนิคการถ่ายภาพขั้นสูงในวิทยาศาสตร์ชีวภาพ