5(6)-Carboxyrhodamine 6G succinimidyl ester ใช้เป็นสารเรืองแสงในงานวิจัยทางชีววิทยาและเคมี โดยเฉพาะในการติดฉลากโมเลกุลชีวภาพ เช่น โปรตีน, เพปไทด์, แอนติบอดี, และกรดนิวคลีอิก เพื่อศึกษาการเคลื่อนที่หรือปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลเหล่านี้ในเซลล์หรือเนื้อเยื่อ ด้วยคุณสมบัติเรืองแสงที่แข็งแกร่งและเสถียร ทำให้เหมาะสำหรับการใช้งานในเทคนิคต่างๆ เช่น กล้องจุลทรรศน์ confocal, การไหลของเซลล์ (Flow Cytometry), การถ่ายโอนพลังงานการเรืองแสงแบบเรโซแนนซ์ (FRET), และการถ่ายภาพโมเลกุลในระบบชีวภาพ นอกจากนี้ ยังใช้ในการตรวจหาสารชีวโมเลกุลในงานวินิจฉัยโรคและการวิจัยทางเภสัชวิทยาเพื่อศึกษาการโต้ตอบและพลวัตของโมเลกุล กลุ่ม succinimidyl ester ช่วยให้การคอนจูเกตกับอะมีนปฐมภูมิได้อย่างมีประสิทธิภาพ สร้างการติดฉลากที่แข็งแกร่งและเสถียรของโมเลกุลชีวภาพ