ใช้ในงานวิจัยด้านชีววิทยาของระบบภูมิคุ้มกัน โดยเฉพาะในการศึกษาบทบาทของโปรตีน CD4 ที่พบบนผิวเซลล์ T-helper ในการตอบสนองของภูมิคุ้มกัน โปรตีนนี้มีความสำคัญต่อการจับกับโมเลกุล MHC class II ในการกระตุ้นเซลล์ T นิยมใช้เป็นเป้าหมายในการพัฒนาแอนติบอดีหรือวัคซีน รวมถึงใช้ในการตรวจสอบการมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีน (protein-protein interaction) โดยเฉพาะกับโปรตีน gp120 ของไวรัส HIV ซึ่งใช้ CD4 เป็นตัวรับหลักในการเข้าสู่เซลล์ เนื่องจากมี His Tag จึงสามารถทำ purification ได้ง่ายด้วยระบบ nickel-affinity chromatography และเหมาะสำหรับการตรวจจับด้วย anti-His tag antibody ในการทดลอง ELISA, Western blot หรือ flow cytometry