ใช้ในงานวิจัยด้านภูมิคุ้มกันวิทยาเพื่อศึกษาการทำงานของเซลล์ T โดยเฉพาะบทบาทของโปรตีน CD3 ที่มีส่วนในการส่งสัญญาณการกระตุ้นของเซลล์ T สามารถนำไปใช้ในการพัฒนาแอนติบอดีโมโนโคลนัลหรือวิเคราะห์ปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนในระบบภูมิคุ้มกัน นิยมใช้ในเทคนิค ELISA, การทำเวสเทิร์นบล็อต หรือการแยกเซลล์ด้วยแม่เหล็ก (magnetic cell sorting) เนื่องจากมีส่วนของ Fc tag ที่ช่วยให้จับกับโปรตีน A หรือ G ได้ดี ทำให้สะดวกต่อการตรวจสอบหรือแยกโปรตีนเป้าหมายออกจากสารตัวอย่าง