ธอรอนถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยทางวิทยาศาสตร์และการตรวจสอบสิ่งแวดล้อม เนื่องจากคุณสมบัติกัมมันตรังสีกัมมันตภาพรังสี มักใช้ในการศึกษาพฤติกรรมของก๊าซเรดอน เนื่องจากธอรอนเป็นผลผลิตจากการสลายตัวของธอเรียมและมีความคล้ายคลึงกับเรดอน ในด้านการตรวจสอบสิ่งแวดล้อม ตัวตรวจจับธอรอนถูกใช้เพื่อวัดความเข้มข้นของมันในอากาศ โดยเฉพาะในพื้นที่ที่มีระดับธอเรียมสูงในดิน ซึ่งช่วยประเมินความเสี่ยงจากการสัมผัสรังสีในสภาพแวดล้อมบางแห่ง เช่น เหมืองแร่หรือพื้นที่ที่มีวัสดุกัมมันตรังสีกัมมันตภาพรังสีตามธรรมชาติ นอกจากนี้ ธอรอนยังถูกใช้ในกระบวนการสอบเทียบอุปกรณ์ตรวจจับรังสี เพื่อให้มั่นใจในการวัดที่แม่นยำในแอปพลิเคชันต่างๆ อายุครึ่งชีวิตที่สั้นทำให้เหมาะสำหรับการทดลองเฉพาะที่ต้องการการสลายตัวอย่างรวดเร็ว