6-Bromo-7-methylquinoxaline ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยทางเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาโมเลกุลที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โดยเฉพาะในการสังเคราะห์อนุพันธ์ควิโนซาลีน อนุพันธ์เหล่านี้มักถูกสำรวจเพื่อคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ รวมถึงกิจกรรมต้านจุลชีพ ต้านเชื้อรา และต้านมะเร็ง นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกลไก เพื่อช่วยในการค้นพบกระบวนการเร่งปฏิกิริยาใหม่และการปรับปรุงเส้นทางการสังเคราะห์ โครงสร้างของสารนี้ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบสารประกอบใหม่สำหรับการค้นพบยาและการประยุกต์ใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุ