2,3-ไดคลอโร-5-เมทิลควิโนซาลีนถูกใช้หลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาส่วนประกอบที่ใช้งานได้จริง โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าต่อการผลิตสารกำจัดวัชพืชและสารกำจัดเชื้อรา ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยเพิ่มประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์สุดท้าย นอกจากนี้ยังนำไปใช้ในการวิจัยอินทรีย์เพื่อสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน สนับสนุนการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและคุณสมบัติ บทบาทของมันในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทอโรไซคลิกทำให้มีความสำคัญในสาขาเคมียารักษาโรค ซึ่งนำไปใช้ในการพัฒนาผู้สมัครยาที่มีศักยภาพ