ใช้ในงานวิจัยทางเภสัชกรรมเป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในการพัฒนายับยั้ง kinase และยาต้านไวรัส โครงสร้างของ 5-โบรโม-7-ฟลูออโรควิโนซาลีน ซึ่งมีโบรมีนและฟลูออรีนแทนที่ สนับสนุนการสร้างระบบเฮเทอโรไซคลิกซับซ้อนที่สำคัญในเคมีทางการแพทย์ เนื่องจากแกนอะโรมาติกที่ขาดอิเล็กตรอน ยังถูกนำมาใช้ในการเตรียมโพรบเรืองแสงและสารกึ่งตัวนำอินทรีย์ นิยมใช้ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามเพื่อสร้างอนุพันธ์ควินอกซาลีนที่ถูกปรับแต่งหน้าที่สำหรับการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ