2-Methylquinoxaline ถูกใช้อย่างแพร่หลายในสาขาการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นหลักสำหรับการผลิตยาและสารเคมีเกษตรต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารต้านจุลชีพและสารต้านเชื้อรา นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเตอร์โรไซคลิกที่ซับซ้อน ซึ่งมักถูกนำมาใช้ในการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ ในอุตสาหกรรมสารเคมีเกษตร มันถูกนำมาใช้ในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืช เนื่องจากความสามารถในการรบกวนกระบวนการทางชีวภาพในศัตรูพืชและวัชพืช นอกจากนี้ 2-Methylquinoxaline ยังพบการประยุกต์ใช้ในการวิจัยและพัฒนาสีเรืองแสงและเซ็นเซอร์ โดยใช้ประโยชน์จากคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ที่เป็นเอกลักษณ์ ความหลากหลายของมันทำให้เป็นส่วนประกอบที่สำคัญในการพัฒนาเคมีทางการแพทย์และเคมีอุตสาหกรรมทั้งสอง