6-Fluoroquinolin-2-amine ถูกใช้หลักในสาขาเคมียารักษาโรคเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายา โดยเฉพาะยาที่เล็งเป้าไปที่การติดเชื้อแบคทีเรีย สารนี้ทำหน้าที่เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในการสร้างยาปฏิชีวนะกลุ่ม fluoroquinolone ซึ่งมีคุณสมบัติต้านแบคทีเรียแบบ broad-spectrum ยาปฏิชีวนะเหล่านี้มีประสิทธิภาพต่อแบคทีเรีย Gram-positive และ Gram-negative หลากหลาย ทำให้มีความสำคัญในการรักษาการติดเชื้อ เช่น การติดเชื้อทางเดินปัสสาวะ การติดเชื้อทางเดินหายใจ และการติดเชื้อที่ผิวหนัง นอกจากนี้ 6-Fluoroquinolin-2-amine ยังถูกสำรวจในการวิจัยและพัฒนายาใหม่ที่อาจมีประสิทธิภาพสูงขึ้น ผลข้างเคียงน้อยลง หรือกิจกรรมต่อเชื้อแบคทีเรียที่ดื้อยา บทบาทของมันในการค้นพบยาเน้นย้ำถึงความสำคัญในการพัฒนาตัวเลือกการรักษาสำหรับต่อสู้กับโรคติดเชื้อ