8-Bromo-6-fluoroquinoline ถูกนำมาใช้เป็นสารกลางในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านแบคทีเรียและยาต้านไวรัส โครงสร้างของมันมีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างโมเลกุลที่เล็งเป้าไปยังการติดเชื้อจากจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาคุณสมบัติของอนุพันธ์ quinoline ซึ่งช่วยในการออกแบบยาใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและมีผลข้างเคียงลดลง