6-Iodoquinolin-4-amine ถูกนำมาใช้หลักในด้านการสังเคราะห์อินทรีย์และการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการพัฒนาสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพหลากหลาย โดยเฉพาะในการสังเคราะห์อนุพันธ์ควิโนลีน ซึ่งมักถูกสำรวจสำหรับคุณสมบัติทางรักษาที่มีศักยภาพ รวมถึงกิจกรรมต้านจุลชีพ ต้านมะเร็ง และต้านการอักเสบ นอกจากนี้ สารประกอบนี้ยังถูกใช้ในการเตรียมลิแกนด์สำหรับคอมเพล็กซ์โลหะ ซึ่งสามารถนำไปใช้ในกระบวนการเร่งปฏิกิริยาเคมีหรือเป็นตัวตรวจสอบในการศึกษาทางชีวเคมี หมู่ไอโอดีนของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าสำหรับการปรับแต่งโครงสร้างเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปปลิ้ง ซึ่งช่วยให้สามารถสร้างโครงสร้างเคมีที่หลากหลายสำหรับการวิจัยและการพัฒนายา