4-Chloro-8-(trifluoromethoxy)quinoline ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม ในด้านยา สารนี้สามารถนำไปพัฒนายาต้านจุลชีพหรือยาต้านมะเร็ง เนื่องจากโครงสร้าง quinoline ที่มีกลุ่มฟังก์ชันเฉพาะช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการออกฤทธิ์ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาเพื่อนำไปใช้เป็นสารป้องกันศัตรูพืชหรือสารกำจัดวัชพืชในเกษตรกรรม โดยอาศัยคุณสมบัติในการยับยั้งการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์หรือพืชที่ไม่ต้องการ