2-Chloroquinolin-6-amine ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับพัฒนายาเภสัชกรรมต่างๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาที่ขัดต่อโรคมาลาเรีย มะเร็ง และการติดเชื้อแบคทีเรีย โครงสร้างของมันช่วยให้สามารถปรับแต่งเพิ่มเติมได้ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อนที่มีผลทางบำบัด นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาและพัฒนาสารเคมีใหม่ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ และมีการศึกษาสำหรับนำไปใช้ในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมเพื่อผลิตยาที่มีคุณสมบัติต้านการอักเสบและต้านอนุมูลอิสระ