ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาต้านมาลาเรีย โดยเฉพาะในการพัฒนาอนุพันธ์ควิโนลีนที่ขัดต่อเชื้อ Plasmodium falciparum ที่ดื้อยา โครงสร้างช่วยให้จับกับโมเลกุลฮีมในปรสิตได้ดีขึ้น รบกวนกระบวนการขจัดพิษ นอกจากนี้ ยังมีการศึกษาความเป็นไปได้ในการใช้เป็นยาในระบบประสาทส่วนกลาง เนื่องจากส่วนพิเพอราซีน-พิริมิดีนมี affinity ต่อตัวรับเซโรโทนินและโดพามีน ใช้ในงานวิจัยเคมีเภสัชเพื่อปรับปรุงคุณสมบัติเภสัชจลนศาสตร์ในยาใหม่