3-Fluoroquinoline-8-carbonitrile ถูกนำมาใช้หลักๆ ในงานวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพต่างๆ โครงสร้างของมันมีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาเป้าหมายสำหรับโรคติดเชื้อและมะเร็ง การมีทั้งกลุ่มฟลูออรีนและไซยาไนด์ช่วยเพิ่มปฏิกิริยา ทำให้เหมาะสำหรับการดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติม นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษากลไกการยับยั้งเอนไซม์ เพื่อช่วยในการค้นพบยารักษาใหม่ๆ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ ที่ซึ่งมันช่วยในการพัฒนาวัสดุอินทรียขั้นสูงที่มีคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์เฉพาะ