4-Amino-2,5-dichloroquinazoline ใช้หลักในการวิจัยเภสัชกรรม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์โมเลกุลที่ biologically active ต่างๆ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่ targeted ต่อเอนไซม์หรือตัวรับเฉพาะ เนื่องจากมีโครงสร้างแกน quinazoline ซึ่งเป็น motif ทั่วไปในเคมียารักษา นักวิจัยนำมาใช้ในการสร้างยารักษาที่มีศักยภาพสำหรับโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง การอักเสบ และการติดเชื้อจากจุลินทรีย์ กลุ่มฟังก์ชันคลอรีนและอะมิโนช่วยให้สามารถดัดแปลงทางเคมีเพิ่มเติมได้ ส่งเสริมการออกแบบยารักษาที่หลากหลาย นอกจากนี้ ยังใช้ในการศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรมเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพและความเลือกเฉพาะของยา